潔凈室按用途分類（可分為兩大類）工業潔凈室和生物潔凈室。工業潔凈室以無生命微粒的控制為對象。主要控制空氣塵埃微粒對工作對象的污染，內部一般保持正壓狀態。生物潔凈室主要控制有生命微粒（細菌）與無生命微粒（塵埃）對工作對象的污染。潔凈室的應用形式多種多樣，下表中列出當前應用潔凈室的一些工業領域。
潔凈室設計最基本的規范：

一、應在大氣含塵濃度較低，自然環境較好的區域； 
二、應遠離鐵路、碼頭、飛機場、交通要道以及散發大量粉塵和有害氣體的工廠、貯倉、堆場等有嚴重空氣污染、振動或噪聲干擾的區域。如不能遠離嚴重空氣污染源時，則應位于其最大頻率風向上風側，或全年最小頻率風向下風側； 三、應布置在廠區內環境清潔、人流貨流不穿越或少穿越的地段。

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